A Crohn betegség ismeretlen eredetű gyulladásos bélbetegség, amely elsősorban a vékonybél alsó részét (ileum) és a vastagbelet érinti, de az emésztő traktus bármely részében előfordulhat.
A familiáris adenomatosus poliposis (FAP) a vastagbél ritka, öröklött megbetegedése, amely a multiplex vastagbél polipok kialakulása miatt fokozott kockázatot jelent vastagbélrák kialakulására.
A vékonybél leggyakrabban előforduló betegségei a vékonybél területi fekélybetegségek, gyulladások, daganatok, vérzések és a felszívódási zavarok.